太湖蓝藻事件后，江苏省无锡市不断寻求环保工作突破的新路径，全力调动政府各部门的力量，营造环境保护一起抓的格局。无锡市审计局积极寻找切入环境保护的结合点，逐步加大了环境审计的力度，并着重对治太资金、环保专项资金、农村环境整治专项资金3方面进行了重点审计，使环保资金明明白白晒到阳光下。
　　治太资金:严密组织，责任到人
　　2007年太湖蓝藻事件发生后，无锡市审计局就积极响应全市开展的“6699”和八大行动，加强治太资金审计。
　　无锡市审计局把太湖治理和环境保护专项审计作为工作的重中之重，成立了太湖治理和环境保护专项审计领导小组，由一把手局长负总责，各分管局长具体负责。他们还专门出台了《无锡审计局关于太湖治理和环境保护专项审计的实施意见》，加强无锡区域范围内环境审计的组织领导。各审计项目落实到相关处室和责任人，明确工作目标、工作重点和工作要求，优先安排审计力量，确保审计任务完成。
　　同时，无锡市审计局积极与环保、财政、农林等部门沟通，对太湖水环境突发事件财政应急资金进行审计。审计人员不辞辛劳，下基层、上渔船、访渔民、问困难，促使144万元专项资金及时到位，确保专款专用，切实发挥资金的使用效益。
　　他们还寓服务于监督之中，积极向有关部门反映基层的实际情况与困难，促使问题及时得到解决，工作得以顺利开展。
　　排污费:督促追缴200多万元
　　国家对直接向环境排放污染物的单位征收排污费，并将其作为环保专项资金全部用于环境污染防治，依法足额征收排污费可以促使企业加大环保投入、减少污染排放。无锡市审计局深入了解排污费征管程序，严格审查其内控制度，并针对其征管基础工作的薄弱环节提出切实可行的审计建议，促使200多万元应缴未缴的排污费足额征缴到位。
　　环保专项资金的合理分配和有效使用可以促进环境污染防治措施的实施。为了深入掌握环保专项资金的使用情况，无锡市审计局积极走访有关部门，深入治污企业，踏勘治污项目，查看治污设施运行情况。审计部门客观评价了环保部门近年来在污染点源治理、监测能力建设等方面的工作，同时，对环保专项资金分配使用中存在的问题提出了整改意见。
　　无锡市审计局还加强对环境保护资金、重点生态保护工程、污染治理项目的审计和审计调查，确保环保资金使用到位。
　　农村环境资金:抓住重点，逐年审查
　　在对农村环境整治专项资金的审计方面，无锡市审计局密切关注农村的环境变化，并对农村环境整治工程专项资金进行年审。
　　无锡市审计局充分认识到农村环境工作的好坏与整个城市的环境质量息息相关，因此非常重视农村环境审计工作。农村环境审计面广、量大，千头万绪，根据江苏省审计厅的统一部署，无锡市审计局每年都组织全市各级审计机关对农村环境工程的几个重点，如农村河道疏浚、村庄环境整治、农村改厕、农村清洁能源工程等进行专项审计，并要求将审计结果向人大常委会报告。
　　仅2006年，无锡市审计局就审计资金近5亿元，较为全面地反映了农村环境工程的投入、管理情况，中肯地评价了此项工作，揭示了存在的问题和不足，提出了合理的建议和意见。
　　同时，无锡市审计局还努力抓好与环境密切相关的水利工程的审计。做好锡澄水厂、锡东水厂改造、仙蠡桥
　　水利枢纽、利民桥水利枢纽等工程的跟踪审计，规范建设行为，确保工程建设质量，有效节约政府资金；做好九里河闸站工程、伯渎港闸站工程、北兴塘枢纽工程等工程的概(预)算执行情况和决算审计，促进政府投资项目管理水平的提高。